Hello World
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GitHub无法访问、443 Operation timed out
针对以下情况: 1.无法访问github，重启电脑，重置网络都无法正常访问。 2.”科学上网”可以访问到GitHub，但是命令行git pull、push等命令无法访问远程库，显示‘Failed to connect to github.com port 443: Operation timed out’。
解决方法：修改系统hosts文件 文章参考
查询github.com的IP地址打开该网址https://www.ipaddress.com/site/github.com
查询github.global.ssl.fastly.net的IP地址打开该网址https://www.ipaddress.com/site/github.global.ssl.fastly.net
查询assets-cdn.github.com的IP地址打开该网址https://www.ipaddress.com/site/assets-cdn.github.com
修改hosts文件Linux和MacOS的hosts文件在/etc/hosts，可以用vim等编辑器打开，需要管理员权限将 ...
CUT&Tag 上游分析流程
代码参考cuttag文章分析流程推荐的代码，基于自己的数据和理解，对部分分析内容做了改动。
需要用到的软件如下：
fastp: 去接头，生成质控报告
bowtie2: 比对测序数据到基因组
samtools/sambamba: 处理比对后的bam/sam文件，例如排序（sort）和去重（markdup）等
bedtools: 用大肠杆菌的基因组进行校准(Spike-in calibration)
MACS2: 进行peak calling，原流程还推荐了SEACR
homer: 对peak进行注释距离最近的基因、外显子、内含子、转录起始位点、基因间区等。
需要用到的数据如下：
参考基因组：可以从NCBI, ENSEMBL 和 UCSC 三个数据库下载到。
大肠杆菌基因组：官网推荐要用大肠杆菌的基因组进行校准, 可从NCBI进行下载
blacklist_region: 基因组黑名单区域，这些区域在多种NGS测序数据中产生异常信号值，影响数据结果。因此进行peak calling之后需要将这些区域去除。
chromsize file: 记录基因组染色体大小的文件 ...